華大基因研究人員發(fā)表東亞江豚的無間隙基因組組裝
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基因功能注釋使用五個公共數(shù)據(jù)庫生成統(tǒng)計維恩圖：NR，InterPro，研究KEGG，發(fā)表西安新城外圍（高級資源）真實外圍女上門外圍大學(xué)生vx《356+2895》提供外圍女上門服務(wù)快速選照片快速安排不收定金面到付款30分鐘可到達SwissProt和KOG。東亞的無（科學(xué)數(shù)據(jù)（2022 年）。組組裝DOI： 10.1038/s41597-022-01868-4）
（神秘的基因江豚間隙基因地球uux.cn）據(jù)美國物理學(xué)家組織網(wǎng)（作者：華大基因）：東亞江豚（Neophocaena asiaeorientalis sunameri）是一種小型淡水鯨類物種。該物種是研究一組小型齒鯨，主要分布在南亞和東亞。發(fā)表分布于西太平洋、東亞的無印度洋、組組裝日本海近海，基因江豚間隙基因在中國海域也出現(xiàn)在渤海、研究黃海、發(fā)表西安新城外圍（高級資源）真實外圍女上門外圍大學(xué)生vx《356+2895》提供外圍女上門服務(wù)快速選照片快速安排不收定金面到付款30分鐘可到達東海、東亞的無南海和長江中下游。組組裝先前的研究發(fā)現(xiàn)，長江江豚（N. a. asiaeorientalis）和東亞有鰭江豚之間的遺傳分化達到了種間水平。
在這項發(fā)表在《科學(xué)數(shù)據(jù)》雜志上的研究中，華大基因的研究人員幫助東亞江豚生成了一個無間隙基因組組裝，為鯨目動物的比較基因組學(xué)和受威脅物種的保護生物學(xué)提供了新的資源。
無間隙基因組組裝意味著整個基因組被拼湊在一起，沒有任何間隙或缺失的部分。產(chǎn)生無間隙基因組組裝是一項重大成就，因為它可以更準(zhǔn)確地理解生物體的遺傳學(xué)，并且可以深入了解其進化歷史。
研究人員成功地為江豚生成了一個無間隙的基因組組裝，這是一項重大成就。它的大小約為 2.5 Gb，超過其 21 條常染色體和兩條性染色體。總共預(yù)測了22，814個蛋白質(zhì)編碼基因，其中97.31%被功能注釋，這意味著95.3%的基因組已被拼湊成連續(xù)的拉伸，沒有任何間隙。
基因組組裝還有一個1.2 Mb的支架N50，這是基因組最大連續(xù)段大小的量度。較大的支架N50表示更高質(zhì)量的全基因組DNA序列重建。研究人員還在基因組組裝中發(fā)現(xiàn)了大量的蛋白質(zhì)編碼基因。
除了生成基因組組裝外，研究人員還進行了各種分析，以調(diào)查江豚的進化歷史和對其水生環(huán)境的適應(yīng)。他們發(fā)現(xiàn)這種可愛的鯨目動物具有遺傳適應(yīng)性，可能對其在淡水棲息地的生存很重要，包括參與滲透調(diào)節(jié)（調(diào)節(jié)體內(nèi)水和電解質(zhì)平衡）和解毒的基因。
研究人員還發(fā)現(xiàn)了許多與聽覺、嗅覺和免疫有關(guān)的基因，這些基因是江豚獨有的。
總體而言，這項研究代表了我們對東亞江豚及其遺傳學(xué)的理解向前邁出的重要一步。無間隙基因組組裝和獨特基因的鑒定可能會為未來對該物種及其進化歷史的研究提供寶貴的資源。
在未來，這項研究可能有助于我們更好地了解和保護這種動物，它在其自然棲息地面臨眾多威脅。它還可能有助于與其他鯨目動物物種進行比較研究，并了解整個鯨目動物的進化歷史。