 科學(xué)家們對(duì)寄生植物Pilostyles aethiopica進(jìn)行了測(cè)序，這種植物生活在其他植物內(nèi)部，科學(xué)只有在開花時(shí)才能看到。團(tuán)隊(duì)蘇州相城區(qū)附近約美女上門崴信159-8298-6630提供外圍女小姐上門服務(wù)快速安排面到付款DNA測(cè)序?qū)@種植物所在的使用示植A生類群進(jìn)行了重新分類。來(lái)源：uux.cn/Sidonie Bellot，字母RBG Kew （神秘的傳密地球uux.cn）據(jù)英國(guó)皇家植物園：英國(guó)皇家植物園領(lǐng)導(dǎo)的279名科學(xué)家組成的國(guó)際團(tuán)隊(duì)今天（4月24日）在《自然》雜志上發(fā)表了一篇新論文，介紹了對(duì)開花植物生命樹的碼揭命樹最新了解。 這一令人難以置信的全球成就利用了來(lái)自9500多個(gè)物種的18億個(gè)字母的遺傳密碼，涵蓋了近8000個(gè)已知的科學(xué)開花植物屬（約60%），為開花植物的團(tuán)隊(duì)進(jìn)化史及其在地球上的生態(tài)優(yōu)勢(shì)提供了新的線索。 該研究的使用示植A生作者認(rèn)為，這些數(shù)據(jù)將有助于未來(lái)在氣候變化和生物多樣性喪失的字母情況下識(shí)別新物種、完善植物分類、傳密發(fā)現(xiàn)新的碼揭命樹藥用化合物以及保護(hù)植物。 這一植物科學(xué)的全球重要里程碑，由邱領(lǐng)導(dǎo)，涉及138個(gè)國(guó)際組織，建立在比任何對(duì)開花植物生命樹的可比研究都多15倍的數(shù)據(jù)之上。在為這項(xiàng)研究測(cè)序的物種中，有800多個(gè)以前從未進(jìn)行過(guò)DNA測(cè)序。 這項(xiàng)研究解鎖的蘇州相城區(qū)附近約美女上門崴信159-8298-6630提供外圍女小姐上門服務(wù)快速安排面到付款數(shù)據(jù)量之大，需要一臺(tái)計(jì)算機(jī)18年的時(shí)間來(lái)處理，這是朝著為所有33萬(wàn)種已知開花植物建造生命之樹邁出的一大步——這是邱生命之樹倡議的一項(xiàng)重大任務(wù)。 RBG Kew研究員Alexandre Zuntini博士表示，“分析這一前所未有的數(shù)據(jù)量，以解碼隱藏在數(shù)百萬(wàn)個(gè)DNA序列中的信息，是一個(gè)巨大的挑戰(zhàn)。但這也為重新評(píng)估和擴(kuò)展我們對(duì)植物生命樹的知識(shí)提供了獨(dú)特的機(jī)會(huì)，為探索植物進(jìn)化的復(fù)雜性打開了一扇新的窗口。”  被子植物生命樹建立在比可比研究多15倍的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)上，涉及9500多種不同開花植物的測(cè)序。來(lái)源：uux.cn/RBG Kew 解鎖歷史植物標(biāo)本館標(biāo)本進(jìn)行尖端研究 開花植物生命樹，就像我們自己的家譜一樣，使我們能夠了解不同物種之間的關(guān)系。生命之樹是通過(guò)比較不同物種之間的DNA序列來(lái)發(fā)現(xiàn)的，以識(shí)別隨著時(shí)間的推移而積累的變化（突變），就像分子化石記錄一樣。 隨著DNA測(cè)序技術(shù)的進(jìn)步，我們對(duì)生命之樹的理解正在迅速提高。在這項(xiàng)研究中，開發(fā)了新的基因組技術(shù)，從每個(gè)樣本中磁性捕獲數(shù)百個(gè)基因和數(shù)十萬(wàn)個(gè)遺傳密碼字母，比早期的方法多了幾個(gè)數(shù)量級(jí)。 該團(tuán)隊(duì)方法的一個(gè)關(guān)鍵優(yōu)勢(shì)是，即使DNA嚴(yán)重受損，也能對(duì)各種各樣的植物材料進(jìn)行測(cè)序，包括新舊植物材料。世界植物標(biāo)本館收藏的大量干燥植物材料寶庫(kù)，包括近4億個(gè)植物科學(xué)標(biāo)本，現(xiàn)在可以進(jìn)行基因研究。 利用這些標(biāo)本，該團(tuán)隊(duì)成功地對(duì)近200年前在尼泊爾采集的一個(gè)沙蒿標(biāo)本（全球沙蒿）進(jìn)行了測(cè)序，盡管其DNA質(zhì)量較差，但仍能將其放入生命之樹。 該團(tuán)隊(duì)甚至分析了已經(jīng)滅絕的植物，比如瓜達(dá)盧佩島橄欖（Hespeelaea palmeri），自1875年以來(lái)就沒有人見過(guò)它活著。事實(shí)上，根據(jù)世界自然保護(hù)聯(lián)盟紅色名錄，已測(cè)序的物種中有511個(gè)已經(jīng)面臨滅絕的風(fēng)險(xiǎn)，其中還有三個(gè)類似于已經(jīng)滅絕的赫斯佩拉。 生命之樹高級(jí)研究負(fù)責(zé)人William Baker教授說(shuō)：“在許多方面，這種新穎的方法使我們能夠通過(guò)利用歷史植物標(biāo)本館中的豐富數(shù)據(jù)與過(guò)去的植物學(xué)家合作，其中一些標(biāo)本早在19世紀(jì)初就被收集到了。 “我們杰出的前輩，如查爾斯·達(dá)爾文或約瑟夫·胡克，無(wú)法預(yù)料這些標(biāo)本在今天的基因組研究中會(huì)有多么重要。DNA甚至在他們的一生中都沒有被發(fā)現(xiàn)！ “我們的工作表明，這些令人難以置信的植物博物館對(duì)地球上生命的開創(chuàng)性研究是多么重要。誰(shuí)知道它們還有哪些未被發(fā)現(xiàn)的科學(xué)機(jī)會(huì)呢？” 在測(cè)序的9506個(gè)物種中，3400多個(gè)來(lái)自48個(gè)國(guó)家的163個(gè)草藥庫(kù)。來(lái)自世界各地植物收藏的額外材料（如DNA庫(kù)、種子、活體收藏）對(duì)于填補(bǔ)關(guān)鍵知識(shí)空白至關(guān)重要，從而為開花植物進(jìn)化史提供新的線索。該團(tuán)隊(duì)還受益于1900多個(gè)物種的公開數(shù)據(jù)，突出了開放科學(xué)方法對(duì)未來(lái)基因組研究的價(jià)值。 揭示達(dá)爾文令人憎惡的奧秘 僅開花植物就占陸地上所有已知植物生命的90%左右，在地球上幾乎無(wú)處不在——從最潮濕的熱帶到南極半島的巖石露頭。然而，我們對(duì)這些植物是如何在起源后不久就占據(jù)主導(dǎo)地位的理解，讓包括查爾斯·達(dá)爾文在內(nèi)的幾代科學(xué)家感到困惑。 開花植物起源于1.4億多年前，之后它們迅速超過(guò)了其他維管植物，包括它們現(xiàn)存的近親裸子植物（種子裸露的非開花植物，如蘇鐵、針葉樹和銀杏）。 達(dá)爾文對(duì)化石記錄中突然出現(xiàn)的這種多樣性感到困惑。在1879年寫給他的密友、RBG邱園主任Joseph Dalton Hooker的一封信中，他寫道：“據(jù)我們所知，在最近的地質(zhì)時(shí)代，所有高等植物的快速發(fā)展是一個(gè)令人憎惡的謎。” 利用200塊化石，作者根據(jù)時(shí)間縮放了他們的生命樹，揭示了開花植物是如何在地質(zhì)時(shí)期進(jìn)化的。他們發(fā)現(xiàn)，早花植物的多樣性確實(shí)激增，在它們起源后不久就產(chǎn)生了今天存在的80%以上的主要譜系。 然而，在接下來(lái)的1億年里，這一趨勢(shì)下降到了一個(gè)更穩(wěn)定的速度，直到大約4000萬(wàn)年前，隨著全球氣溫的下降，多樣化再次激增。這些新的見解會(huì)讓達(dá)爾文著迷，肯定會(huì)幫助今天的科學(xué)家應(yīng)對(duì)理解物種如何以及為什么多樣化的挑戰(zhàn)。  為這項(xiàng)研究測(cè)序的最古老的植物是納撒尼爾·沃利奇于1829年收集的一個(gè)干燥的全球阿倫納利植物標(biāo)本館標(biāo)本。來(lái)源：RBG Kew 真正的全球合作 如果沒有邱大學(xué)的科學(xué)家與全球許多合作伙伴的合作，組裝一棵如此廣泛的生命樹是不可能的。總共有279名作者參與了這項(xiàng)研究，他們代表了來(lái)自27個(gè)國(guó)家138個(gè)組織的許多不同國(guó)籍。其中包括澳大利亞植物基因組學(xué)（GAP）聯(lián)盟，他們是該團(tuán)隊(duì)技術(shù)的早期采用者，并與邱園密切合作，最大限度地增加樹上的澳大利亞植物物種數(shù)量。 國(guó)際合作者還分享了他們獨(dú)特的植物學(xué)專業(yè)知識(shí)，以及許多來(lái)自世界各地的珍貴植物樣本，如果沒有他們的幫助，這些樣本是無(wú)法獲得的。這棵樹的綜合性在很大程度上是這種奇妙伙伴關(guān)系的結(jié)果。 澳大利亞生物平臺(tái)公司項(xiàng)目經(jīng)理、GAP聯(lián)盟的Mabel Lum博士表示：“我們很自豪能成為RBG Kew建立全球研究基礎(chǔ)設(shè)施的主要合作伙伴和合作者，以促進(jìn)我們對(duì)開花植物生命樹的理解。這一富有成果的合作強(qiáng)調(diào)了我們致力于促進(jìn)科學(xué)研究的創(chuàng)新和合作，為未來(lái)的發(fā)現(xiàn)提供了跳板，這將有助于塑造我們對(duì)未來(lái)幾代人自然世界的理解。”  Alstonia spectabilis是一種對(duì)當(dāng)?shù)氐骂D人具有重要藥用價(jià)值的物種，并首次被測(cè)序。來(lái)源：uux.cn/RBG Kew 好好利用生命之樹 開花植物生命樹在生物多樣性研究中具有巨大的潛力。這是因?yàn)椋缛藗兛梢愿鶕?jù)元素在周期表中的位置來(lái)預(yù)測(cè)元素的性質(zhì)一樣，物種在生命樹中的位置也讓我們能夠預(yù)測(cè)其性質(zhì)。因此，這些新數(shù)據(jù)將對(duì)加強(qiáng)許多科學(xué)領(lǐng)域及其他領(lǐng)域具有寶貴價(jià)值。 為了實(shí)現(xiàn)這一點(diǎn)，公眾和科學(xué)界都可以公開、自由地訪問(wèn)這棵樹和支撐它的所有數(shù)據(jù)，包括通過(guò)邱園生命樹探索者。該研究的作者認(rèn)為，這種開放獲取是全球科學(xué)數(shù)據(jù)民主化的關(guān)鍵。 開放獲取還將幫助科學(xué)家充分利用這些數(shù)據(jù)，例如將其與人工智能相結(jié)合，預(yù)測(cè)哪些植物物種可能包括具有藥用潛力的分子。同樣，生命之樹可以用來(lái)更好地了解和預(yù)測(cè)病蟲害未來(lái)將如何影響英國(guó)的植物。作者指出，最終，這些數(shù)據(jù)的應(yīng)用將由訪問(wèn)這些數(shù)據(jù)的科學(xué)家的獨(dú)創(chuàng)性驅(qū)動(dòng)。 RBG邱園高級(jí)研究負(fù)責(zé)人Melanie Jayne Howes博士不是這項(xiàng)研究的作者，但她將在研究中利用這些數(shù)據(jù)，她說(shuō)：“植物化學(xué)物質(zhì)激發(fā)了許多藥物的靈感，但在幫助未來(lái)藥物發(fā)現(xiàn)方面仍有巨大的未開發(fā)潛力。挑戰(zhàn)在于知道在從約33萬(wàn)種開花植物中尋找新藥的過(guò)程中應(yīng)該科學(xué)地研究哪種。”。 “在邱大學(xué)，我們正在應(yīng)用人工智能來(lái)預(yù)測(cè)哪些植物物種含有對(duì)瘧疾有藥用潛力的化學(xué)物質(zhì)。這一龐大的新數(shù)據(jù)集的可用性為加強(qiáng)這些預(yù)測(cè)提供了令人興奮的機(jī)會(huì)，從而加快了從植物中發(fā)現(xiàn)瘧疾和其他疾病的藥物。”  這棵新的生命樹重新分類了寬花菊的科和屬，寬花菊是一種結(jié)著奇異果實(shí)的熱帶小樹。來(lái)源：uux.cn/Danilo Tandang 開花植物生命樹中的杰出物種 因野生山羊而滅絕：Hespeelaea palmeri，也稱為瓜達(dá)盧佩島橄欖（olivo de la Isla de Guadalupe）。根據(jù)1875年醫(yī)生愛德華·帕爾默在墨西哥下加利福尼亞州瓜達(dá)盧佩島采集的邱園植物標(biāo)本進(jìn)行測(cè)序。一種屬于橄欖科（木犀科）的樹，由于非本地山羊過(guò)度放牧，現(xiàn)已滅絕。 已測(cè)序的最古老的標(biāo)本：格氏Arenaria globiflora，也被稱為尼泊爾沙蒿。根據(jù)1829年納撒尼爾·沃利奇在邱園采集的植物標(biāo)本進(jìn)行測(cè)序。這個(gè)引人注目的標(biāo)本來(lái)自一種生長(zhǎng)在海拔3600米以上的喜馬拉雅山植物。 寄生植物家族之謎被解開：毛柄菌，莖吸盤科（Apodathaceae）的成員。根據(jù)Kew的Sidonie Bellot于2012年在津巴布韋收集的植物組織測(cè)序。這種奇怪的寄生蟲生活在其他植物的樹枝里，只有當(dāng)它開花時(shí)才能看到。此前人們認(rèn)為它與南瓜和秋海棠（Cucurbitals）有密切的親緣關(guān)系，研究發(fā)現(xiàn)它屬于Malpighiales群。 奇特的熱帶樹木，重新分類：寬花菊，黃山毛櫸科（Stemonuraceae）的成員。根據(jù)1993年在印度尼西亞新幾內(nèi)亞采集的邱園植物標(biāo)本進(jìn)行測(cè)序。這種熱帶小樹結(jié)著奇異的針果，以前被歸入冬青科。新生命樹將其屬和科重新分類到一個(gè)全新的目中。 胡克19世紀(jì)50年代喜馬拉雅山探險(xiǎn)隊(duì)的竹子：頭倒立草，禾本科植物。根據(jù)1850年RBG Kew的第二任主任Joseph Hooker和他的朋友Thomas Thomson在印度采集的植物標(biāo)本進(jìn)行測(cè)序。 首次對(duì)藥用植物進(jìn)行測(cè)序：壯觀的Alstonia spectabilis，也被特頓人稱為Kroti metan。根據(jù)1954年在巴布亞新幾內(nèi)亞采集的邱園植物標(biāo)本進(jìn)行測(cè)序。這棵20米高的大樹生長(zhǎng)在東南亞和澳大利亞的熱帶雨林中。盡管對(duì)西帝汶的德頓人來(lái)說(shuō)，治療瘧疾在醫(yī)學(xué)上很重要，也是一種寶貴的木材來(lái)源，但其DNA以前從未被測(cè)序過(guò)。 |